Oferty pracy w projektach finansowanych przez NCN
Narodowe Centrum Nauki prezentuje bazę ogłoszeń o wolnych stanowiskach pracy przy projektach finansowanych przez Centrum. Narodowe Centrum Nauki nie ponosi odpowiedzialności za treść i wiarygodność przesyłanych ofert pracy.
Uprzejmie informujemy o nowych warunkach zatrudniania osób na stanowiska typu post-doc: limit czasu upływającego od uzyskania stopnia doktora dla aplikujących na te stanowiska kobiet może być przedłużony o 1,5 roku za każde urodzone bądź przysposobione dziecko.
Oferta pracy
Nazwa stanowiska: Doktorant (2 stanowiska)
Wymagania:
1. Tytuł zawodowy magistra chemii, fizyki, biologii, bioinformatyki, biotechnologii lub dziedzin pokrewnych lub udokumentowana perspektywa uzyskania tego tytułu do dnia 1.12.2024.
2. Znajomość języka angielskiego na poziomie co najmniej umożliwiaja֒cym samodzielne czytanie prac naukowych w tym je֒zyku oraz podstawową komunikację.
3. Znajomość molekularnej mechaniki kwantowej, mechaniki statystycznej oraz metod chemii obliczeniowej. Wskazane doświadczenie w prowadzeniu symulacji dynamiki molekularnej oraz analizy wyników symulacji.
4. Znajomość metod statystycznej analizy danych. Wskazana znajomość metody analizy czyników g łównych (PCA) oraz metod uczenia maszynowego.
5. Znajomość podstaw organizacji strukturalnej białek.
6. Umiejętność pracy na stacjach roboczych pod systemem UNIX na poziomie co najmniej średniozaawansowanego użytkownika. Wskazana jest również co najmniej podstawowa znajomość programowania w językach C/C++/Fortran.
Celem projektu jest (i) określenie roli dalekozasięgowych korelacji pomiędzy resztami aminokwasowymi dalekimi w sekwencji, które nie oddziałują ze sobą bezpośrednio w tworzeniu struktury trzeciorzędowej białek, (ii) wykorzystanie otrzymanych wyników do wzbogacenia gruboziarnistego pola siłowego UNRES (https://unres.pl) w odpowiadaja֒ce im wkłady do energii, które powinny polepszyć jego zdolność do modelowania skomplikowanych globalnych zwinięć białek, (iii) zbadanie wpływu wyżej wymienionych korelacji na dynamikę białek, w szczególności na komunikację allosteryczną oraz wyjątkową efektywność rotujących motorów molekularnych. Doktorant będzie uczestniczył w realizacji następujących zadań:
1. Parametryzacja i implementacja nowych wkładów korelacyjnych do pola siłowego UNRES oraz kalibracja i testowanie pola siłowego z tymi wkładami.
2. Analiza baz danych Protein Data Bank oraz AlphaFold, w celu określenia wpływu długozasięgowych wkładów korelacyjnych propagujących się wzdłuż łańcucha polipeptydowego na tworzenie regularnych struktur w białkach.
3. Badanie kolektywnych ruchów wybranych białek metodą pełnoatomowej oraz gruboziarnistej dynamiki molekularnej (z użyciem modelu UNRES), w celu zidentyfikowania długozasięgowych gruboziarnistych wkładów korelacyjnych odpowiedzialnych za te ruchy.
4. Badanie dynamiki rotujących motorów molekularnych przy użyciu gruboziarnistej dynamiki molekularnej, wspomaganej przez pełnoatomową dynamikę molekularną, w celu znalezienia przyczyny ich zdolności przekształcania ruchów termicznych w ruch obrotowy oraz ich niezwykle wysokiej wydajności.
Termin składania ofert: 1 grudnia 2024, 00:00
Forma składania ofert: dowolnie
Warunki zatrudnienia:
1. Umowa stypendialna l a֒cznie na okres do 4 lat.
2. Środki przewidziane na miesie֒czne stypendium: 5000 PLN brutto na okres do 4 lat.
3. Kandydat be֒dzie słuchaczem Szkoły Doktorskiej Wydziału Chemii Uniwersytetu Gdańskiego.
4. Przewidywany czas rozpocze֒cia: 25.02.2025.
Dokumenty wymagane do aplikacji:
1. List motywacyjny.
2. Życiorys naukowy zawierający listę publikacji.
3. Kopia dyplomu ukończenia studiów II stopnia, dopuszczalny skan lub wersja elektroniczna.
4. List rekomendacyjny od promotora pracy magisterskiej. Można dołączyć dodatkowe listy rekomendacyjne, np. od promotora pracy licencjackiej.
Dokumenty można złożyć osobiście w Biurze Dziekana Wydziału Chemii UG, ul. Wita Stwosza 63, 80-308 Gdańsk, wysłać pocztą, adresuja֒c przesyłkę do prof. J.A. Liwo lub wysłać pocztą elektroniczną na adres adam.liwo@ug.edu.pl (preferowany sposób). W tym ostatnim przypadku list motywacyjny może być treścią listu elektronicznego, do którego proszę dołączyć skany dokumentów.
Wraz z wymaganymi dokumentami należy złożyć podpisaną klauzulę informacyjną, dotyczącą przetwarzania danych osobowych (do pobrania ze strony UG lub od kierownika projektu).
Po upływie terminu składania, zgłoszenia zostaną poddane wstępnej selekcji a wybrani kandydaci zostaną zaproszeni na rozmowę kwalifikacyjną która odbędzie się w trybie zdalnym lub stacjonarnym lub na Wydziale Chemii UG. O terminie rozmowy kwalifikacyjnej wybrani Kandydaci zostaną powiadomieni drogą mailową.
Pytania w sprawie oferty proszę kierować mailowo do prof. Liwo na adres
adam.liwo@ug.edu.pl lub adam.liwo@gmail.com.
Zgłoszena powiny być złożone do dnia 1.12.2024. Zgłoszenia nadesłane po tym terminie będą rozpatrywane, jeżeli wcześniej nie zostanie dokonany ostateczny wybór dwóch Kandydatów.