Oferty pracy w projektach finansowanych przez NCN
Narodowe Centrum Nauki prezentuje bazę ogłoszeń o wolnych stanowiskach pracy przy projektach finansowanych przez Centrum. Narodowe Centrum Nauki nie ponosi odpowiedzialności za treść i wiarygodność przesyłanych ofert pracy.
Uprzejmie informujemy o nowych warunkach zatrudniania osób na stanowiska typu post-doc: limit czasu upływającego od uzyskania stopnia doktora dla aplikujących na te stanowiska kobiet może być przedłużony o 1,5 roku za każde urodzone bądź przysposobione dziecko.
Oferta pracy
Nazwa stanowiska: Scholarship Student
Wymagania:
Wymagania:
- Znajomość podstaw technik modelowania molekularnego takich jak dynamika molekularna i dokowanie
- Umiejętność pracy z systemem Linux
- Znajomość podstaw programowania
- Znajomość podstaw biologii molekularnej
- Umiejętność pracy z programami do wizualizacji białek i analizy dynamiki molekularnej (np. VMD)
Requirements:
- Knowledge of the basics of molecular modeling techniques, such as molecular dynamics and docking
- Proficiency in Linux system
- Basic programming skills
- Basic knowledge of molecular biology
- Ability to use software for protein visualization and molecular dynamics analysis (e.g., VMD)
Opis zadań:
Celem studenta będzie przeprowadzenie symulacji dokowana ligandów fotoaktywnych (azobenzenów) w konformacji trans i cis do niestandardowego enzymu biotechnologicznego Hydrataza nitrylowa. Analiza otrzymanych wyników dokowania. Na podstawie najlepszych konformacji z dokowania przygotowanie symulacji dynamiki molekularnej (MD) dla różnych wariantów mutacyjnych enzymu hydratazy nitrylowej (NHase) z zadokowanym substratem i potencjalnymi produktami. Analiza wyników symulacji MD oraz ocena różnic w oddziaływaniach wariantów mutacyjnych NHase z dokowanymi ligandami.
Zadania:
- Przygotowanie fotoaktywnych ligandów w formie trans i cis do dokowania
- Przygotowanie białka NHazy do dokowania
- Wykonanie dokowania w takich programach jak AutoDock, Schrodinger i inne
- Analiza Dokowania, propozycja wprowadzenia mutacji.
- Przygotowanie symulacji Dynamiki Molekularnej (MD) NHazy z zadokowanymi ligandami w formie trans i cis.
- Analiza otrzymanych wyników z MD
- Przygotowywanie skryptów automatyzujących dokowanie oraz do analizy dynamiki molekularnej
Description of duties:
The student’s aim will be to perform docking simulations of photoactive ligands (azobenzenes) in the trans and cis conformations to a non-standard biotechnological enzyme, nitrile hydratase. Analysis of the obtained docking results. Based on the best conformations from the docking, preparation of molecular dynamics (MD) simulations for various mutant variants of the nitrile hydratase (NHase) enzyme with the docked substrate and potential products. Analysis of the MD simulation results and evaluation of differences in the interactions between NHase mutant variants and the docked ligands.
Tasks:
- Preparation of photoactive ligands in trans and cis forms for docking
- Preparation of the NHase protein for docking
- Performing docking using software such as AutoDock, Schrodinger, and others
- Docking analysis and proposal of mutations
- Preparation of molecular dynamics (MD) simulations of NHase with docked trans and cis ligands
- Analysis of MD results
- Development of scripts to automate docking and molecular dynamics analysis
Termin składania ofert: 31 maja 2026, 23:59
Forma składania ofert: email
Warunki zatrudnienia:
Stypendium w wysokości 1500 zł/m-c przez okres do 12 miesięcy.
Planowany okres zatrudnienia: do 12 miesięcy, 1.07.2026-30.06.2027
A scholarship in the amount of PLN 1500 per month for a period of up to 12 months.
Planned period of employment: up to 12 months, up to 12 months, 1 July 2026–30 June 2027
Stypendium przyznawane jest zgodnie z zasadami zawartymi w Regulaminie przyznawania stypendiów naukowych Narodowego Centrum Nauki, wprowadzonym uchwałą Rady Narodowego Centrum Nauki nr 25/2024 z dnia 4 marca 2024 r.
Wymagane dokumenty (należy przesłać na adres email kierownika projektu: drpepe@fizyka.umk.pl z adnotacją „Opus 29.1):
• List motywacyjny
• CV
• Kopie uzyskanych dyplomów i certyfikatów (jeśli dotyczy)
• Kopia lub skan publikacji kandydata (jeśli dotyczy)
• Informacje o nagrodach naukowych, stypendiach i innych wyróżnieniach (jeśli dotyczy)
• Opis aktualnej działalności badawczej (jeśli dotyczy)
• Zgoda na przetwarzanie danych osobowych (https://view.officeapps.live.com/op/view.aspx?src=https%3A%2F%2Fwww.umk.pl%2Fuczelnia%2Fiod%2FKonkurs.docx&wdOrigin=BROWSELINK).
• Zaświadczenie o statusie studenta
Kandydaci będą oceniani przez komisję konkursową powołaną przez Dziekana WFAiIS. Komisja zarekomenduje przyznanie (lub odmowę przyznania) stypendium najpóźniej 10.06.2026 r. O wyniku postępowania konkursowego kandydaci zostaną powiadomieni pocztą elektroniczną. W przypadku rezygnacji wybranego kandydata zastrzega się prawo do wskazania kolejnego kandydata z listy rankingowej./
Język składania wniosków: polski lub angielski.
Wszystkie dokumenty powinny zawierać podpis kandydata lub jego skan.
The scholarship is awarded in accordance with the rules set out in the Regulations on the Award of Research Scholarships of the National Science Centre, adopted by Resolution No. 25/2024 of the Council of the National Science Centre dated 4 March 2024..
Required documents (please send these to the project manager’s email address: drpepe@fizyka.umk.pl, with the subject line ‘Opus 29.1’):
• Cover letter
• CV
• Copies of obtained diplomas and certificates (if any)
• Copy or scan of candidate’s publications (if any)
• Information about scientific awards, scholarships and other distinctions (if any)
• Description of current research activity (if applicable)
• Consent to the processing of personal data (https://view.officeapps.live.com/op/view.aspx?src=https%3A%2F%2Fwww.umk.pl%2Fuczelnia%2Fiod%2FKonkurs_EN.docx&wdOrigin=BROWSELINK).
• Certificate of student status
Applicants will be evaluated by a selection committee appointed by the Dean of the Faculty of Physics, Astronomy and Informatics. The committee will recommend the awarding (or rejection) of the scholarship no later than 10 June 2026.
Candidates will be notified of the outcome of the competition by e-mail.
In the event of resignation of the selected candidate, the right to indicate the next candidate from the ranking list is reserved.
All documents should contain the candidate's signature or its scan.
Language of application: Polish or English.