Oferty pracy w projektach finansowanych przez NCN
Narodowe Centrum Nauki prezentuje bazę ogłoszeń o wolnych stanowiskach pracy przy projektach finansowanych przez Centrum. Narodowe Centrum Nauki nie ponosi odpowiedzialności za treść i wiarygodność przesyłanych ofert pracy.
Uprzejmie informujemy o nowych warunkach zatrudniania osób na stanowiska typu post-doc: limit czasu upływającego od uzyskania stopnia doktora dla aplikujących na te stanowiska kobiet może być przedłużony o 1,5 roku za każde urodzone bądź przysposobione dziecko.
Oferta pracy
Nazwa stanowiska: Doktorant/Doktorantka (Stypendysta/Stypendystka)
Wymagania:
- mgr kierunków biomedycznych (np. analityka medyczna, medycyna, farmacja, biotechnologia, biologia molekularna, bioinformatyka i inne)
- osoba zainteresowana zaaplikowaniem do Szkoły Doktorskiej Collegium Medicum UJ (nauki medyczne) w ramach naboru na rok akademicki 2026/2027
- gotowość do ukierunkowania pracy naukowej i zainteresowań badawczych w stronę patofizjologii, biologii molekularnej i farmakologii schorzeń przewodu pokarmowego
- bardzo dobra znajomość biomedycznego języka angielskiego
- zdolność do opanowania i implementacji nowych metod badawczych i protokołów eksperymentalnych (gotowość do opanowania umiejętności pracy z użyciem platformy Seahorse® do oceny aktywności mitochondriów)
- spełnienie wymagań formalnych w kwestii zatrudniania na stanowisku doktoranta w ramach projektów NCN
Poszukujemy preferencyjnie osoby posiadającej doświadczenie i umiejętność analizy oraz wizualizacji danych pochodzących z metod wysokoprzepustowych, w szczególności z eksperymentów proteomicznych i transkryptomicznych. Idealny kandydat/kandydatka powinien:
- Umieć interpretować dane tabelaryczne przedstawiające zmiany poziomów ekspresji białek lub transkryptów pomiędzy różnymi grupami badawczymi.
- Rozumieć kierunki i istotność zmian biologicznych w kontekście porównawczym.
- Potrafić przygotować estetyczne, przejrzyste i publikowalne ryciny, które w sposób czytelny prezentują kluczowe wyniki.
Dodatkowym atutem będzie znajomość narzędzi takich jak R (ggplot2, pheatmap), Python (matplotlib, seaborn) (np. wykresy wulkaniczne, mapy cieplne, diagramy wzbogacenia szlaków biologicznych), GraphPad, Cytoscape, czy BioRender również doświadczenie w analizach in silico, w szczególności w zakresie dokowania molekularnego oraz modelowania oddziaływań ligand–białko. Umiejętność wykorzystania narzędzi bioinformatycznych do przewidywania potencjalnych mechanizmów działania związków oraz ich interakcji z celami molekularnymi będzie mile widziana.
Mile widziane (PL):
- znajomość praktyczna technik biologii molekularnej i biochemii (np. Western blot, PCR, ELISA i inne)
- doświadczenie i umiejętność prowadzenia hodowli komórkowych in vitro,
- doświadczenie naukowe udokumentowane publikacjami (w tym m.in. umiejętność opracowania tekstów naukowych, prezentacji naukowych, planowania prac eksperymentalnych oraz analizy danych z użyciem narzędzi statystycznych)
- znajomość podstawowych technik inżynierii genetycznej (np. klonowanie molekularne, sekwencjonowanie DNA, hodowle bakteryjne) oraz zasad pracy w laboratorium o standardzie BSL2
- zainteresowanie patogenezą i farmakologią schorzeń przewodu pokarmowego, fizjologią i patofizjologią funkcjonalną mitochondriów oraz post-translacyjnymi modyfikacjami białek wewnątrzkomórkowych, a także sygnalizacją endogennych gazowych mediatorów (biosynteza i metabolizm siarkowodoru, tlenku węgla i tlenku azotu)
- zainteresowanie technikami wysokoprzepustowymi (np. proteomika)
- umiejętność pracy w środowisku R
- doświadczenie w pracy naukowej ze zwierzętami laboratoryjnymi lub gotowość do podjęcia się takiej pracy
- umiejętność pracy z biologicznym materiałem klinicznym oraz umiejętność wyprowadzania pierwotnych hodowli komórkowych
- doświadczenie badawcze w jednostkach zagranicznych
Oferta pracy dotyczy stanowiska doktoranta/doktorantki (stypendysty/stypendystki) w projekcie finansowanym przez Narodowe Centrum Nauki, Sonata Bis (2023/50/E/NZ4/00360), pt. Celowana komórkowa sygnalizacja cząsteczek siarkowodoru jako brakujący klucz do fundamentalnej i klinicznej interpretacji schorzeń przełyku.
Protokół eksperymentalny opiera się na odpowiednich modelach in vitro schorzeń błony śluzowej przełyku z wykorzystaniem unikatowej kombinacji ludzkich linii komórkowych nabłonka przełyku, w tym modyfikowanych genetycznie techniką CRISPR/Cas9 oraz na mikrochirurgicznym modelu zwierzęcym. Porównawczo, zaplanowano również kliniczną analizę molekularną bioptatów błony śluzowej przełyku pobranych endoskopowo od pacjentów. Projekt zakłada kompleksowe zbadanie mechanizmów biochemicznych i molekularnych biorących udział w rozwoju przełyku Barrett'a z zastosowaniem technik biochemicznych oraz proteomicznych. Ten patologiczny proces może być potencjalnie modulowany przez mitochondrialnie ukierunkowane działanie gazowego mediatora jakim jest siarkowodór (H2S) oraz zależną od biodostępności tej molekuły post-translacyjnej persulfidacji białek wewnątrzkomórkowych. Zakładamy, że procesy te mogą być odwracalne i będziemy w tym celu implementować w warunkach przedklinicznych odpowiednie nowatorskie proleki uwalniające H2S weryfikując skuteczność terapeutyczną oraz prewencyjną takich rozwiązań farmakologicznych. Projekt jest realizowany w wieloośrodkowej współpracy międzynarodowej.
Przykładowe zadania projektowe (pod opieką naukową doświadczonych badaczy):
- prowadzenie hodowli komórkowych w ramach modelu in vitro przełyku Barrett’a celem weryfikacji terapeutycznej efektywności nowych proleków z użyciem metod klasycznych oraz czytnika wielodetekcyjnego w warunkach normoksji oraz hipoksji
- prowadzenie hodowli komórkowych w kierunku oceny zmian aktywności mitochondrialnej pod wpływem badanych związków z użyciem platformy Seahorse®; opracowanie protokołu oraz implementacja nowej metody
- projektowanie i wykonanie oznaczeń molekularnych, w tym m.in. oznaczenie poziomu białek i ich ekspresji z użyciem immunelektroforezy kapilarnej (system Jess® Automated Western Blot), technologii multipleksowania xMAP®
- biochemiczne przygotowanie lizatów komórkowych do oznaczeń proteomicznych oraz persulfidomicznych
- aplikacja badanych substancji oraz zabezpieczenie materiału do dalszych badań laboratoryjnych w ramach prac na modelu zwierzęcym
- projektowanie i wykonanie oznaczeń molekularnych w materiale klinicznym oraz zwierzęcym (w tym opracowanie metody izolacji frakcji mitochondrialnych)
- analiza, wizualizacja i archiwizacja danych, przygotowanie publikacji naukowych oraz doniesień konferencyjnych
Termin składania ofert: 21 lipca 2026, 00:00
Forma składania ofert: email
Warunki zatrudnienia:
- gotowość do pracy w ruchomym, zależnym od danego protokołu eksperymentalnego
(średniorocznie odpowiadająca pełnemu etatowi, 30-40 godzin tygodniowo, w zadaniowym systemie czasu pracy)
- możliwe 48 miesięcy zatrudnienia (z okresowymi punktami weryfikacyjnymi)
- termin rozpoczęcia pracy (możliwy): październik 2026 r.
- wynagrodzenie: progresywnie, od 5000 (1, 2 rok) do ok. 7500-8000 (3,4 rok) PLN brutto/m-c
- miejsce wykonywania pracy: Ośrodek Biomedycyny i Nauk Interdyscyplinarnych, Wydział Lekarski, Uniwersytet Jagielloński – Collegium Medicum w Krakowie
- praca w dynamicznie rozwijającym się zespole i ośrodku badawczym, realizującym projekty badawcze we współpracy z prestiżowymi jednostkami zagranicznymi (np. Erasmus MC w Rotterdamie (Niderlandy), Georgia State University (USA), Baylor University Medical Center (USA), University of Glasgow (Wielka Brytania), Newcastle University (Wielka Brytania), Uniwersytet Neapolitański Fryderyka II (Włochy); dotychczasowe publikacje zespołu ukazały się w czołowych czasopismach z dziedziny farmakologii, biologii molekularnej, biochemii i gastroenterologii (np. Gastroenterology (5-IF ok 30), Redox Biology (5-IF ok. 16), Pharmacological Research (5-IF ok 12), Journal of Controlled Release (5-IF ok 12), Acta Pharmaceutica Sinica B. 5-IF ok. 15), Nature Communications (5-IF ok 17), Chemical Reviews (5-IF ok 63.6) i inne); nasz zespół realizował i realizuje wiele projektów finansowanych przez Narodowe Centrum Nauki, Narodowe Centrum Badań i Rozwoju, Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego i innych; Ośrodek i projekt są kierowane przez prof. dr hab. n. med. Marcina Magierowskiego (laureata nagrody NCN 2024 w dziedzinie Nauk o Życiu);
Więcej o nas:
- https://gameg.cm-uj.krakow.pl
- https://www.youtube.com/watch?v=FIpYIsoKvYA&t=4s
- https://www.youtube.com/watch?v=L_jIb-10ux8&t=3386s
- wymagane dokumenty: CV, list motywacyjny
- mile widziane: referencje od poprzednich pracodawców, opiekunów naukowych
- zgłoszenia należy wysyłać do prof. dr hab. n. med. Marcina Magierowskiego (na adres: m.magierowski@uj.edu.pl) do 21.07.2026.