16th JPIAMR transnational call for research projects - AMR diagnostics and surveillance 2023 (DISTOMOS)

General Information

• Type: Partner looking for project
• Organisation: Centre National de la Recherche Scientifique et Technologique / Institut de Recherche en Sciences Appliquées et Technologies
• Country: Burkina Faso (BF)
• Career stage: Early Career Researcher (up to 8 years** since PhD).

Research area

• Scientific area(s) of the call:
  1. Topic 2: to develop or improve existing strategies, technologies or methods, or data use strategies to support One Health AMR surveillance
• One Health Setting:
  Food
  Environment (incl. natural and built)

• Keywords:

  bactériophages; clone d\'exclusion compétitive; Bactérie multirésistantes; lutte biologique; One health;

• Brief description of your expertise / expertise you are looking for:

  Nos travaux de recherche menés depuis 2014 jusqu’à nos jours portent sur la microbiologie et la bio-informatique sur diverses sources telles que les selles diarrhéiques, la volaille, la viande, les aliments vendus dans la rue, les légumes et les eaux usées des canaux d’évacuation utilisées pour l’irrigation des légumes qui ont montré de fortes prévalences des souches de E. coli, de Salmonella et de Shigella multi-résistantes aux antibiotiques. Durant notre thèse nous avons obtenu une bourse de mobilité de la coopération française qui nous a conduit à l’Institut Pasteur de Dakar au Sénégal où nous avons appris à travailler avec les outils d’analyse biomoléculaire et bio-informatique. Les techniques de transfert de gènes (conjugaison) ont été explorées dans le but de connaitre les mécanismes de dissémination des pathogènes tant dans le milieu clinique, dans l’environnement comme chez les animaux dans un contexte de “One health”.

• Brief description of your project / the project you would like to join:

  Vu l’ampleur grandissante de phénomène de résistance qui devient de plus en plus inquiétante de nos jours, il est impérieux de connaitre les mécanismes de dissémination des gènes de résistance à travers les techniques de séquençage du génome complet en vue de développer des méthodes alternatives de lutte contre ces pathogènes multi-résistants. La phagothérapie est l’une des techniques la plus efficace de lutte biologique. L\'objectif principal est de contribuer efficacement à développer une méthode de contrôle et de lutte contre les bactéries multi-résistantes dans un contexte de one health. Les activités qui seront menées sont i) la purification des bactéries (entérobactéries) multi-résistantes provenant des environnements hospitaliers, des aliments ainsi que les phages spécifiques, ii) le séquençage du génome complet des souches de bactéries entéro-pathogènes multi-résistantes, iii) l’analyse des données à l’aide des outils de bio-informatiques et iv) la mise aux points de la technique de lutte biologique. La mise en place d\'un tel projet contribuera à contrôler et à limiter la propagation de la résistance des pathogènes aux antimicrobiens qui est devenu un problème de santé publique.

SOMDA Namwin Siourimè

• Organisation: Centre National de la Recherche Scientifique et Technologique / Institut de Recherche en Sciences Appliquées et Technologies
• Position:
• E-mail: namwin.somda@gmail.com
• Phone: 00226 78684411 / 71817221